Можжевельник чешуйчатый произрастает на горных склонах в Гималаях и на северо-западе Китая на высоте 1600–4800 над уровнем моря. Его форма может варьироваться, как и у других можжевельников. Из него может вырасти небольшое дерево, иногда он стелется по земле, но чаще всего он представляет собой вертикально растущий кустарник.
Кончики веток можжевельника чешуйчатого красиво поникают. Широкие, изогнутые игловидные листья с острыми концами располагаются группами по три штуки. Из-за синеватого оттенка иголок можжевельник чешуйчатый иногда называют синим можжевельником. Цвет иголок может варьироваться от синевато-зеленых до сильно выраженных голубых оттенков. В холодные месяцы на них появляются коричневые и бронзовые тона.
Шишка-ягода можжевельника чешуйчатого, черная в зрелом виде, имеет овальную форму, а внутри нее находится всего одно семя. В шишкоягодах других можжевельников обычно находится сразу несколько семян.
Обычно выращивают не естественные формы можжевельника чешуйчатого, а различающиеся размерами и окраской сорта. Первый из выращиваемых можжевельников чешуйчатых имел синюю как сталь окраску хвои. Его в начале ХХ века обнаружил Франк Мейер, и сейчас этот сорт известен под названием 'Meyeri'.